從2008年起，團隊幫助國內最大的能源公司(台灣中油公司)進行微藻能源生技研發平台，包括篩選本土高油脂含量微藻藻株，並利用物理化學突變法或基因工程法進行藻株之改良強化。也幫中油公司建立各種微藻培養方法及建構培養微藻之戶內戶外高效能光生物反應器，並篩選適合進行微藻煙道氣固碳之藻株及戶外固碳測試，近年來則朝向微藻高值化應用之方向進行研發，如進行微藻色素及抗氧化功能性成分之分析鑑定等。目前中油公司綠能研究所所使用的藻株，大多為本團隊所開發，且中油公司之藻類研究平台，也是由本團隊幫忙建立。近年來與中油公司之合作計畫案如下：

 2009年起，藉由能源國家型計畫的支持，本團隊與中鋼公司合作，建立以中鋼公司實場煙道氣，直接進行微藻養殖，以達到生物固碳及CO₂再利用之目的。於中鋼公司建立的煙道氣展示模場，為國內首創，並得到國內外各界的關注，本團隊也於2011-2012年將該技術轉移至中鋼公司(如下表所示)，建立該公司在微藻生質能及微藻煙道氣減碳領域研發之基礎。目前仍持續與中鋼公司合作開發以中鋼轉爐石建構海洋牧場進行減碳及高值化應用(能源國家型計畫第二期產學計畫『整合二氧化碳礦化封存與海藻固碳再利用營造海洋牧場之研究(1/3)』105-3113-E-006 -017 -CC2)，企圖以鈣化之中鋼轉爐石為基材，建構以藻類為主的海洋生態農場，進行後續藻類減碳及高價產品之開發。

技術轉移給中鋼公司之微藻固碳及微藻生質能技術

團隊與雷迪詩生物科技股份有限公司，藉由科技部開發型產學計畫(名稱：『具抗氧化或抗發炎功能之微藻美容保養品開發』(1/3), (2/3), (3/3))，於三年期間，開發一系列微藻化妝保養品，並以由該公司進行商業化。

與雷迪詩生物科技股份有限公司合作開發之綠藻美容系列產品

團隊亦與國內『綠茵生技股份有限公司』及日本廠商DIC Co. 合作，積極開發以微藻進行葉黃素(lutein)之生產，所開發之藻種除了可直接食用外，其葉黃素含量達7.0 mg/g，是金盞花的20倍以上，且其所養殖之微藻細胞密度，在混營培養(mixotrophic growth)條件下可達20 g/L，葉黃素productivity可達5-7 mg/L/d並已成功測試戶外培養規模達200噸以上，已進入商業化量產階段。

微藻葉黃素開發

團隊開發的葉黃素藻種與生產效率技術，在國際文獻上居領先地位，所發表微藻葉黃素相關論文如下：

1. Ho et al. (2015) Effects of nitrogen source availability and bioreactor operating strategies on lutein production with Scenedesmus obliquus FSP-3. Bioresour Technol 184: 131-138. [SCI; IF= 4.494]
2. Lin et al. (2015) Lutein in specific marigold flowers and microalgae. J Taiwan Inst Chem Eng 49:90-94. [IF= 3.00]
3. Lin et al. (2015) Lutein production from biomass: marigold flowers versus microalgae. Bioresour Technol 184: 421-428. [SCI; IF= 4.494]
4. Chang et al. (2015) Enhancement of Lutein Yield from Coagulated Chlorella sp. ESP-6 with Sodium Hypochlorite. Drying Technol 33(4): 429-433 [SCI; IF= 1.518]
5. Xie et al. (2014) Simultaneous enhancement of CO₂ fixation and lutein production with thermo-tolerant Desmodesmus sp. F51 using a repeated fed-batch cultivation strategy. Biochem Eng J 86: 33–40 [SCI; IF=2.467].
6. Ho et al. (2014) Enhancing Lutein Productivity of an Indigenous Microalga Scenedesmus obliquus FSP-3 Using Light-Related Strategies. Bioresour Technol 152:275-282. [SCI; IF= 4.494]
7. Xie et al. (2013) Phototrophic cultivation of a thermo-tolerant Desmodesmus sp. for lutein production: Effects of nitrate concentration, light intensity and fed-batch operation. Bioresour Technol 144: 435–444. [SCI; IF=4.494]
8. Chan et al. (2013) Characterization, extraction and purification of lutein produced by an indigenous microalga Scenedesmus obliquus CNW-N. Biochem Eng J 78:24-31. [SCI; IF= 2.467 ]
9. Utomo et al. (2013) Lutein Recovery from Chlorella sp. ESP-6 with Coagulants. Bioresour Technol 139: 176–180. [SCI; IF=4.494]