1. 與中鋼公司合作開發微藻煙道氣二氧化碳減碳模場技術 (基於能源國家型計畫「微藻生質能源整合型技術開發三年計畫（100-3113-E-006-016）」之研究成果)。 (2011.8.-2014.7) 具體績效：技術轉移 NT200,000; 技術名稱：「大型光生物反應器模組」(技轉案)
2. 與財團法人花蓮石材與資源中心合作開發應用深層海水養殖藻類生產油脂與葉黃素之關鍵技術，並合作執行兩件產學合作計畫。(2011.5-2012.1) 具體績效：產學合作計畫(一)：『微細藻油脂與葉黃素萃取及純化先期研究』(NT3,000,000，已結案)；產學合作計畫(二)：『藻類光反應器培育環境最佳化設計』(NT2,000,000)
3. 日本JST CREST 計畫，計畫題目：”Isolation, characterization and optimal cultivation of indigenous carbohydrate-rich microalgae used as feedstock for bioethanol production (III)” (2012.4.01-2013.3.31) 具體績效：國際合作計畫 (1,558,305 yen) (國際合作案)
4. 與中國鋼鐵股份有限公司新材料研究發展處合作執行計畫「薄膜蒸餾法水回收技術之開發」(2011.11-2012.12) 具體績效: 產學合作計畫(NT$ 1,250,000)
5. 與工業技術研究院合作執行計畫「儲集層結垢抑制關鍵技術開發」(2012.03-2012.11) 具體績效: 產學合作計畫(NT$ 1,350,000)
6. 與中國鋼鐵股份有限公司新材料研究發展處合作執行計畫「產油微藻之藻油生質柴油生產流程之建立」(2012.05-2013.04) 具體績效: 產學合作計畫(NT$ 950,000)
7. 與工業技術研究院合作執行計畫「學界主導產品創新應用技術開發計畫-開發低成本高效能袋式微藻培養系統生產多元為飽和脂肪酸」(2012.06-2012.12) 具體績效: 產學合作計畫(NT$ 600,000)
8. 與中國石油股份有限公司嘉義煉研所合作執行計畫「微藻菌株改良研究」(2012.08-2013.07) 具體績效: 產學合作計畫(NT$830,000)
9. 與中國石油股份有限公司綠能所合作執行計畫「以微藻進行二氧化碳減量之策略研究」(2012.08-2013.08) 具體績效: 產學合作計畫(NT$835,800)
10. 與美商康健生技生活事業股份有限公司台灣分公司合作執行計畫「康健系列產品配方研究」(2012.10-2013.09) 具體績效: 產學合作計畫(NT$600,000)
11. 日本JST CREST 計畫，計畫題目：”Isolation, characterization and optimal cultivation of indigenous carbohydrate-rich microalgae used as feedstock for bioethanol production (Ⅳ)” (2013.4.01-2014.3.31) 具體績效：國際合作計畫 (1,526,175 yen) (國際合作案)
12. 日本JST CREST 計畫，計畫題目：”Isolation, characterization and optimal cultivation of indigenous carbohydrate-rich microalgae used as feedstock for bioethanol production (Ⅴ)” (2014.4.01-2015.3.31) 具體績效：國際合作計畫 (1,558,305 yen) (國際合作案)
13. 與中國石油股份有限公司合作執行計畫「開放式與密閉式微藻養殖研究」(2013.07-2014.06) 具體績效: 產學合作計畫(NT$850,000)
14. 與綠茵生技股份有限公司合作執行計畫「高營養價值藻種之戶外放大培養與藻體成分之萃取及加工條件優化」(2014.03-2015.12) 具體績效: 產學合作計畫(NT$4,000,000)；先期技轉金台幣300萬元。
15. 與日本DIC Corporation合作執行計畫「色素生產優勢藻種篩選與適化生產技術之建立」(2014.07-2015.12) 具體績效: 產學合作計畫(NT$503,800) (國際合作案)
16. 與工業技術研究院合作執行計畫「大屯山地熱區高溫硫氧化菌篩選」(2015.03-2015.11)具體績效: 產學合作計畫(NT$984,000)
17. 與工業技術研究院合作執行計畫「蛋白固定化效能測試及菌體醱酵勞務」(2015.07-2015.11)具體績效: 產學合作計畫(NT$800,000)
18. 與工業技術研究院合作執行計畫「菌株100L酉發酵操作因子測試勞務」(2016.03-2016.08)具體績效: 產學合作計畫(NT$900,000)
19. 與工業技術研究院合作執行計畫「大屯山地熱區高溫硫酸還原菌篩選勞務」(2016.04-2016.11)具體績效: 產學合作計畫(NT$300,000)
20. 與工業技術研究院合作執行計畫「固定化蛋白與樹脂吸金測試勞務」(2016.04-2016.05)具體績效: 產學合作計畫(NT$112,500)
21. 與工業技術研究院合作執行計畫「菌株100L醱酵溶氧及饋料策略測試勞務」(2016.08-2016.11)具體績效: 產學合作計畫(NT$300,000)
22. 與工業技術研究院合作執行計畫「微生物分解碳酸氫鹽轉化琥珀酸測試勞務」(2016.02-2016.11)具體績效: 產學合作計畫(NT$700,000)
23. 與工業技術研究院合作執行計畫「菌株100L醱酵測試勞務」(2016.02-2016.11)具體績效: 產學合作計畫(NT$750,000)
24. 與工業技術研究院合作執行計畫「磺嘴山地熱資源補充調查-微生物多樣性分析」(2016.03-2016.10)具體績效: 產學合作計畫(NT$650,000)
25. 與工業技術研究院合作執行計畫「地熱水樣有價元素分析」(2016.05-2016.06)具體績效: 產學合作計畫(NT$150,000)
26. 與日本Kobe University及OP Bio Factory Co. Ltd合作計畫，計畫題目：” Improving microalgal biomass production by photobioreactor design and cultivation strategies” (2016.4.14-2017.4.14) 具體績效：國際合作計畫 (3,000,000yen) (國際合作案)

技術轉移案